Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav1P27870 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms