Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klra1P20937 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms