Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms