Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxb1P17919 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxb1P17919 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxb1P17919 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxb1P17919 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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