Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa-rs1P17533 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms