Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfr1P16092 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfr1P16092 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms