Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmnb1P14733 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms