Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P10404 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P10404 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P10404 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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