Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms