Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt10P02535 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms