Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
JtbO88824 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
JtbO88824 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
JtbO88824 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms