Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme6O88425 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms