Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms