Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfdp1O88271 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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