Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma3O70435 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma3O70435 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma3O70435 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma3O70435 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma3O70435 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms