Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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