Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfibp2O35711 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms