Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf11aO35305 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms