Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ptpn9O35239 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms