Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn4O35054 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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