Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
U90926O08546 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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U90926O08546 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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U90926O08546 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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U90926O08546 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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U90926O08546 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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U90926O08546 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
U90926O08546 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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