Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm3336J3QMQ6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm3336J3QMQ6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3336J3QMQ6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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