Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sclt1G5E861 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sclt1G5E861 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms