Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Vmn1r34G3XA52 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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