Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm5798F7BTS7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5798F7BTS7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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