Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm20538F6Z9R1 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms