Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9887F6RFI0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9887F6RFI0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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