Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Herc6F2Z461 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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