Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Myo5cE9Q1F5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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