Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smok3bC0HKC9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smok3bC0HKC9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms