Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms