Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zbed5B2RPU8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed5B2RPU8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms