Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Grik3B1AS29 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms