Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cavin4A2AMM0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms