Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdc27A2A6Q5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms