Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms