Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Akap17bA2A3V1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Akap17bA2A3V1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Akap17bA2A3V1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms