Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd2l1A2A259 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pkd2l1A2A259 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pkd2l1A2A259 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pkd2l1A2A259 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pkd2l1A2A259 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd2l1A2A259 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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