Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm4T1NXB5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms