Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccne2Q9Z238 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms