Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf394Q9Z1D9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf394Q9Z1D9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms