Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn3Q9Z0G9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn3Q9Z0G9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn3Q9Z0G9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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