Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfwd2Q9R1A8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms