Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms