Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AmfrQ9R049 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AmfrQ9R049 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms