Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf11Q9QYK7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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