Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx8Q9QXV1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms