Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rad18Q9QXK2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms