Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx5Q9JL61 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx5Q9JL61 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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