Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx5Q9JKQ4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx5Q9JKQ4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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